一些生物遗迹中的有机物经过长时间的分解，一些坚硬的部分会和周围的沉积物一起石化成石头，但仍保留着原来的形状和结构，逐渐形成化石。时间久了，骨骼逐渐分解，只剩下一个空腔，其他矿物质填补了空隙，逐渐形成化石。还有一些小生物，如果滴入植物的滴树脂中，也不会分解形成自然标本。